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亚博取款快速到账:亚博取款快速到账倪鹏博士、聂藩博士学术报告

来源: 点击: 时间:2022年06月29日 09:55


一:

报告题目:基于纳米孔测序技术的5mC检测方法

报告时间:202271日 上午9:30-10:30

报告地点:计算机楼313

人:倪鹏

报告摘要:

DNA 5mC甲基化是表观遗传学中的一个重要研究问题,其在染色质结构和组织水平上的生物过程中起主要作用。近年来三代测序技术(PacBio SMRT测序和Oxford 纳米孔测序)迅速发展。其中纳米孔测序的电信号对碱基修饰比较敏感,可以直接用来检测DNA甲基化,而无需额外实验技术。并且,纳米孔测序成本低廉,目前已逐渐成为主流的三代测序检测DNA甲基化的技术手段。本团队利用纳米孔测序数据,开发了基于深度学习的5mC检测方法,可准确预测出DNA CpG位点的甲基化状态。

二:

报告题目:基于高错误率长读数的二倍体组装方法

报告时间:202271日 上午10:30-11:30

报告地点:计算机楼313

人:聂藩

报告摘要:

基因组组装是基因功能分析,基因多样表达和调控分析,基因多样性分析等多种下游分析的基础。长读数的长度优势有利于组装出更连续的结果,但其较高的测序错误影响了组装质量。特别是组装二倍体物种时,测序错误会掩盖二倍体数据的单倍型差异,从而组装成一条单倍型混合的序列。因此完整地组装出二倍体的两个单倍型是一个巨大的挑战。本报告将介绍一种使用高错误率长读数的二倍体组装方法,它能够从测序错误中识别单倍型差异,从而完成对二倍体读数的纠错和组装。

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